Thực vật Danh_sách_những_bộ_gen_lạp_thể_đã_giải_trình

Thực vật Danh_sách_những_bộ_gen_lạp_thể_đã_giải_trình_tự

Rêu (theo nghĩa rộng)

Plastome đã giải trình tự
Loài	Cặp base	Gen	Chú thích	Ghi chú
Aneura mirabilis	108.007		[3][4]	rêu tản ký sinh; plastome chứa nhiều gen giả
Anthoceros formosae	161.162	122	[5]	rêu sừng; plastome bị RNA chỉnh sửa mạnh
Marchantia polymorpha	121.024		[6]	rêu tản
Nothoceros aenigmaticus	153.208	124	[7]	rêu sừng
Pellia endiviifolia	120.546	123	[8]	rêu tản
Physcomitrella patens	122.890	118	[9]	rêu
Ptilidium pulcherrimum	119.007	122	[10]	rêu tản
Tortula ruralis	122.630		[11]	rêu

Dương xỉ và Thạch tùng

Plastome đã giải trình tự
Loài	Cặp base	Gen	Chú thích	Họ
Adiantum capillus-veneris	150.568		[12]	Pteridaceae
Alsophila spinulosa	156.661	117	[13]	Cyatheaceae
Angiopteris evecta	153.901		[14]	Marattiaceae
Equisetum arvense	133.309			Equisetaceae
Huperzia lucidula	154.373		[15]	Lycopodiaceae
Isoetes flaccida	145.303			Isoetaceae
Psilotum nudum	138.829	117	[16]	Psilotaceae
Selaginella uncinata	138.829		[17]	Selaginellaceae

Plastome dương xỉ và thạch tùng đã giải trình tự không bao gồm thông tin về kích cỡ, số lượng gen và/hoặc chú thích.
Loài	Thứ	Cặp base	Gen	Chú thích	Họ	Ghi chú
Equisetum hyemale					Equisetaceae
Lygodium japonicum					Lygodiaceae
Marsilea crenata					Marsileaceae
Ophioglossum californicum					Ophioglossaceae
Selaginella moellendorffii					Selaginellaceae

Thực vật hạt trần

Plastome đã giải trình tự
Loài	Cặp base	Gen	Chú thích	Họ
Cryptomeria japonica	131.810	114	[18]	Cupressaceae
Cycas micronesica			[19]	Cycadaceae
Cycas taitungensis	163.403	133	[20]	Cycadaceae
Ephedra equisetina				Ephedraceae
Ginkgo biloba	156.945	134	[21]	Ginkgoaceae
Gnetum parvifolium				Gnetaceae
Pinus koraiensis	116.866			Pinaceae
Pinus thunbergii	119.707		[22]	Pinaceae
Podocarpus macrophyllus				Podocarpaceae
Welwitschia mirabilis	119.726	101	[23]	Welwitschiaceae

Thực vật có hoa

Bảng phân loại dưới đây dự kiến sẽ sưu tập những bộ gen lạp thể hoàn chỉnh đại diện cho một phạm vi rộng nhất về kích cỡ, số lượng gen và các họ thực vật có hoa.

Plastome đã giải trình tự với thông tin hoàn chỉnh về kích cỡ bộ gen, số lượng gen duy nhất, chú thích và năm công bố.
Loài	Cỡ (cặp base)	Gen	Chú thích	Năm	Họ	Ghi chú
Acorus americanus	153.819		[19]	2007	Acoraceae
Agrostis stolonifera	135.584	110	[24]	2010	Poaceae
Alniphyllum eberhardtii	155.384	113	[25]	2017	Styracaceae
Alstroemeria aurea	155.510	112	[26]	2013	Alstroemeriaceae
Amborella trichopoda	162.686		[27]	2003	Amborellaceae
Anethum graveolens	153.356		[19]	2007	Apiaceae
Arabidopsis thaliana	154.478		[28]	1999	Brassicaceae
Atropa belladonna	156.687		[29]	2002	Solanaceae
Brachypodium distachyon	135.199	110	[24]	2010	Poaceae
Buxus microphylla	159.010	113	[30]	2007	Buxaceae
Calycanthus floridus var. glaucus	153.337	115	[31]	2003	Calycanthaceae
Carpinus tientaiensis	160.104	114	[32]	2017	Betulaceae
Chloranthus spicatus	157.772	113	[30]	2007	Chloranthaceae
Citrus sinensis var. 'Ridge Pineapple'	155.189		[33]	2006	Rutaceae
Cocos nucifera	154.731	130	[34]	2013	Arecaceae
Coffea arabica	155.189		[35]	2007	Rubiaceae
Coix lacryma-jobi	140.745		[36]	2009	Poaceae
Conopholis americana	45.673	42	[37]	2013	Orobanchaceae	Thực vật ký sinh không quang hợp
Cucumis sativus	155.293		[38]	2007	Cucurbitaceae
Cuscuta exaltata	125.373		[39]	2007	Convolvulaceae
Cuscuta gronovii	86.744	86	[40]	2007	Convolvulaceae
Cuscuta reflexa	121.521	98	[40]	2007	Convolvulaceae
Cypripedium formosanum	178.131		[41]	2015	Orchidaceae
Cytinus hypocistis	19.400	23	[42]	2016	Cytinaceae	Thực vật toàn ký sinh
Daucus carota	155.911		[43]	2006	Apiaceae
Dioscores elephantipes	152.609	112	[30]	2007	Dioscoreaceae
Drimys granadensis	160.604	113	[44]	2006	Winteraceae
Epifagus virginiana	70.028	42	[45]	1992	Orobanchaceae
Epipogium aphyllum	30.650	27	[46]	2015	Orchidaceae	Thực vật dị dưỡng phụ thuộc nấm
Epipogium roseum	19.047	29	[46]	2015	Orchidaceae	Thực vật dị dưỡng phụ thuộc nấm
Erodium carvifolium	116.935	107	[47]	2016	Geraniaceae
Erodium chrysanthum	168.946	96	[47]	2016	Geraniaceae
Erodium texanum	130.812	106	[48]	2011	Geraniaceae
Eucalyptus globulus subsp. globulus	160.286		[49]	2005	Myrtaceae
Fagopyrum esculentum ssp. ancestrale	159.599		[50]	2008	Polygonaceae
Geranium palmatum	155.794	105	[48]	2011	Geraniaceae
Glycine max	152.218		[51]	2005	Fabaceae
Gossypium barbadense	160.317	114	[52]	2006	Malvaceae
Gossypium hirsutum	160.301		[53]	2006	Malvaceae
Helianthus annuus	151.104		[54]	2007	Asteraceae
Hordeum vulgare subsp. vulgare	136.482	110	[24]	2010	Poaceae
Hydnora visseri	27.233	24	[55]	2016	Aristolochiaceae	Thực vật toàn ký sinh không quang hợp
Illicium oligandrum	148.552	113	[30]	2007	Schisandraceae (sensu APG III)
Ipomoea purpurea	162.046		[39]	2007	Convolvulaceae
Jasminum nudiflorum	165.121		[56]	2007	Oleaceae
Juglans regia	160.367	129	[57]	2017	Juglandaceae
Lactuca sativa	152.765		[54]	2007	Asteraceae
Lemna minor	165.955		[58]	2008	Araliaceae
Licania alba	162.467	112	[59]	2014	Chrysobalanaceae
Lilium longiflorum	152.793	114	[26]	2013	Liliaceae
Liriodendron tulipifera	159.866		[44][60]	2006	Magnoliaceae
Lolium perenne	135.282	110	[24]	2010	Poaceae
Lonicera japonica	155.078		[1]	2010	Caprifoliaceae
Lotus japonicus	150.519		[61]	2000	Fabaceae
Manihot esculenta	161.453		[62]	2008	Euphorbiaceae
Monotropa hypopitys	35.336	45	[63]	2016	Ericaceae	Thực vật dị dưỡng phụ thuộc nấm
Monsonia speciosa	128.787	106	[48]	2011	Geraniaceae
Morus indica	156.599		[64]	2006	Moraceae
Musa balbisiana	169.503	113	[65]	2016	Musaceae
Nandina domestica	156.599		[66]	2006	Berberidaceae
Neottia nidus-avis	92.060	56	[67]	2011	Orchidaceae	Thực vật dị dưỡng phụ thuộc nấm
Nelumbo nucifera	163.330		[1]	2010	Nelumbonaceae
Nicotiana tabacum	155.943	113	[68]	1986	Solanaceae
Nuphar advena	160.866	117	[69]	2007	Nymphaeaceae
Nymphaea alba	159.930		[70]	2004	Nymphaeaceae
Oenothera argillicola strain douthat 1	165.055	113	[71]	2008	Onagraceae
Oenothera biennis strain suaveolens Grado	164.807	113	[71]	2008	Onagraceae
Oenothera elata subsp. hookeri strain johansen	165.728	113	[71]	2008	Onagraceae
Oenothera glazioviana strain rr-lamarckiana Sweden	165.225	113	[71]	2008	Onagraceae
Oenothera parviflora strain atrovirens Standard	163.365	113	[71]	2008	Onagraceae
Oryza sativa indica 93-11	134.496		[72]	2005	Poaceae
Oryza sativa japonica Nipponbare	134.551	110	[24][73]	1989	Poaceae
Oryza sativa japonica PA64S	134.551		[72]	2005	Poaceae
Osyris alba	147.253	101	[74]	2015	Santalaceae	Thực vật bán ký sinh
Panax ginseng	156.318		[75]	2004	Araliaceae
Pelargonium × hortorum	217.942		[76]	2006	Geraniaceae
Petrosavia stellaris	103.835	58	[77]	2014	Petrosaviaceae	Thực vật dị dưỡng phụ thuộc nấm
Phalaenopsis aphrodite subsp. formosana	148.964		[78]	2006	Orchidaceae
Phaseolus vulgaris 'Negro Jamapa'	150.285		[79]	2007	Fabaceae
Pilostyles aethiopica	11.348	5	[80]	2016	Apodanthaceae	Thực vật nội toàn ký sinh
Pilostyles hamiltonii	15.167	5	[80]	2016	Apodanthaceae	Thực vật nội toàn ký sinh
Piper cenocladum	160.624	113	[44]	2006	Piperaceae
Platanus occidentalis	161.791		[66]	2006	Platanaceae
Populus alba	156.505		[81]	2006	Salicaceae
Ranunculus macranthus	155.158	117	[69]	2007	Ranunculaceae
Rhizanthella gardneri	59.190	33	[82]	2011	Orchidaceae	Thực vật dị dưỡng phụ thuộc nấm ngầm đất
Saccharum officinarum	141.182	110	[24]	2010	Poaceae
Sciaphila densiflora	21.485	28	[83]	2015	Triuridaceae	Thực vật dị dưỡng phụ thuộc nấm
Solanum tuberosum	155.298		[84]	2006	Solanaceae
Sorghum bicolor	140.754	110	[24]	2010	Poaceae
Spinacia oleracea	150.725		[85]	2001	Amaranthaceae
Trachelium caeruleum	162.321		[86]	2008	Campanulaceae
Trifolium subterraneum	144.763	111	[87]	2008	Fabaceae
Triticum aestivum cv. Chinese Spring	134.545	110	[24][88][89]	2000	Poaceae
Typha latifolia	165.572	113	[24]	2010	Typhaceae
Vaccinium macrocarpon	176.045	147	[90]	2013	Ericaceae
Viscum album	128.921	96	[74]	2015	Viscaceae	Thực vật bán ký sinh
Viscum minimum	131.016	99	[74]	2015	Viscaceae	Thực vật bán ký sinh
Vitis vinifera	160.928		[91]	2006	Vitaceae
Yucca schidigera	156.158		[21]	2005	Asparagaceae (sensu APG III)
Zea mays	140.384	110	[24][92]	2010	Poaceae

Plastome đã giải trình tự không bao gồm thông tin về kích cỡ, số lượng gen và/hoặc chú thích.
Loài	Cỡ (cặp base)	Chú thích	Năm	Họ
Acorus calamus	153.821			Acoraceae
Aethionema cordifolium				Brassicaceae
Aethionema grandiflorum				Brassicaceae
Antirrhinum majus		[1]	2010	Plantaginaceae
Arabis hirsuta				Brassicaceae
Aucuba japonica		[1]	2010	Garryaceae
Bambusa oldhamii	139.350			Poaceae
Barbarea verna				Brassicaceae
Berberidopsis corallina		[1]	2010	Berberidopsidaceae
Brassica rapa				Brassicaceae
Bulnesia arborea		[1]	2010	Zygophyllaceae
Capsella bursa-pastoris				Brassicaceae
Carica papaya				Caricaceae
Ceratophyllum demersum		[93]	2007	Ceratophyllaceae
Cornus florida		[1]	2010	Cornaceae
Crucihimalya wallichii				Brassicaceae
Cuscuta obtusiflora				Convolvulaceae
Cuscuta reflexa				Convolvulaceae
Dendrocalamus latiflorus	139.365			Poaceae
Dillenia indica		[1]	2010	Dilleniaceae
Draba nemorosa				Brassicaceae
Ehretia acuminata		[1]	2010	Boraginaceae
Elaeis oleifera		[19]	2007	Arecaceae
Euonymus americanus		[1]	2010	Celastraceae
Festuca arundinacea				Poaceae
Ficus sp.		[1]	2010	Moraceae
Guizotia abyssinica				Asteraceae
Gunnera manicata		[1]	2010	Gunneraceae
Hedyosmum		chưa công bố		Chloranthaceae
Heuchera sanguinea		[1]	2010	Saxifragaceae
Ilex cornuta		[1]	2010	Aquifoliaceae
Lepidium virginicum				Brassicaceae
Liquidambar styraciflua (syn. Altingia styraciflua)		[1]	2010	Altingiaceae
Lobularia maritima				Brassicaceae
Lotus corniculatus				Fabaceae
Medicago truncatulata	124.033			Fabaceae
Megaleranthis saniculifolia	159.924			Ranunculaceae
Meliosma cuneifolia		[1]	2010	Sabiaceae
Nasturtium officinale				Brassicaceae
Olimarabidopsis pumila				Brassicaceae
Phoenix dactylifera				Arecaceae
Nerium oleander	154.903			Apocynaceae
Nicotiana sylvestris	155.941			Solanaceae
Nicotiana tomentosiformis	155.745			Solanaceae
Oryza nivara	134.494			Poaceae
Oxalis latifolia		[1]	2010	Oxalidaceae
Passiflora biflora		[19]	2007	Passifloraceae
Phoradendron leucarpum		[1]	2010	Viscaceae
Plumbago auriculata		[1]	2010	Plumbaginaceae
Populus trichocarpa		[94]	2006	Salicaceae
Quercus nigra		[1]	2010	Fagaceae
Rhododendron simsii		[1]	2010	Ericaceae
Scaevola aemula		[19]	2007	Goodeniaceae
Solanum bulbocastanum	155.371			Solanaceae
Solanum lycopersicum	155.460			Solanaceae
Staphylea colchica		[1]	2010	Staphyleaceae
Trithuria (syn. Hydatella)		chưa công bố		Hydatellaceae
Trochodendron aralioides		[1]	2010	Trochodendraceae
Ximenia americana			2010	Ximeniaceae [95]